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  • miRNA芯片數據發掘分析

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    miRNA芯片數據發掘分析

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    miRNA芯片數據發掘分析
     

    • 芯片聚類分析


    二、microRNA靶基因預測
    “TargetScanS”,“miRanda (miRBase)”,“miRGen”等數據庫預測差異microRNA的所有靶基因。

    • 靶基因GO分析

    根據Gene Ontology數據庫對靶基因進行功能顯著分析,從而篩選顯著性功能的靶基因。

     
     
     
     
     

    • 靶基因pathway分析

    根據KEGG數據庫對靶基因進行Pathway分類,并進行顯著性分析從而得到顯著性的Pathway分類。


    • 構建MicroRNA與基因的調控網絡

    通過構建MicroRNA與基因的調控網絡,可以從中找出hub基因及hub microRNA.

    • microRNA 、靶基因、轉錄因子調控網絡

    microRNA也會受到轉錄因子調控造成表達差異,通過系統研究轉錄因子與基因間的調控關系,可以為尋找重要轉錄因子及重要基因提供線索。


    • microRNA啟動子分析及甲基化位點分析

    當microRNA研究日趨火熱,越來越多的研究者開始關注microRNA本身甲基化變化。MicroRNA基因的甲基化變化也是造成microRNA表達差異的重要原因。


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